Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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