Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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