Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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