Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms