Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CTSSP25774 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CTSSP25774 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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