Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RYR3Q15413 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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