Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FSHR-201ENST00000304421 2176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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TRIM35Q9UPQ4 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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TRIM35Q9UPQ4 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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TRIM35Q9UPQ4 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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TRIM35Q9UPQ4 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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