Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXF2Q12947 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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