Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RUBCNL-206ENST00000409879 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 NRP1-212ENST00000432372 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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FOXC1Q12948 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 ATP13A4-201ENST00000295548 2157 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 TMEM35A-201ENST00000372930 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SPDYE9P-202ENST00000571071 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SPDYE11-203ENST00000573748 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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