Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
APOBRQ0VD83 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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