Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TIGD7-201ENST00000396862 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ELF5-202ENST00000312319 2450 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ANKRD20A21P-202ENST00000623715 3588 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RNASE9-207ENST00000555230 2668 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ENTHD1-201ENST00000325157 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC005304.2-201ENST00000580134 1982 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HKDC1-201ENST00000354624 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 CFAP52-201ENST00000352665 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SAMD7-202ENST00000428432 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 SERPINA5-208ENST00000554866 2211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 ARL17A-201ENST00000329240 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP5-3Q6L8H2 MIR646-201ENST00000385067 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms