Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSC4Q9Y5U2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms