Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHAC2Q9Y5I4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms