Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD3Q9Y3P4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms