Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BP1Q9Y3L3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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