Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC5Q9UQL6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC5Q9UQL6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms