Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF8Q9UPP1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms