Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAF8Q9UPN6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAF8Q9UPN6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms