Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC9Q9UKV0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC9Q9UKV0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms