Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHIC2Q9UKJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHIC2Q9UKJ5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms