Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRTO4Q9UKD2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms