Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHORDC1Q9UHD1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms