Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18L2Q9UHA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SS18L2Q9UHA2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms