Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPG2Q9UBF2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms