Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms