Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL9Q9P2J3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms