Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4Q9P0V3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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