Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKD2L1Q9P0L9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms