Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP1Q9NZI2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms