Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms