Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK12Q9NYV4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms