Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RDH8Q9NYR8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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