Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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PGPEP1Q9NXJ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PGPEP1Q9NXJ5 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PGPEP1Q9NXJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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