Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLN6Q9NWW5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms