Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3EQ9NVU0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms