Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO28Q9NVF7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO28Q9NVF7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms