Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMSN1Q9NSI8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms