Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHST12Q9NRB3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHST12Q9NRB3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms