Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INCENPQ9NQS7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INCENPQ9NQS7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INCENPQ9NQS7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
INCENPQ9NQS7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INCENPQ9NQS7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
INCENPQ9NQS7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms