Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB9BQ9NP90 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms