Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNMDQ9H2S6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNMDQ9H2S6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms