Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD4Q9H223 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms