Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms