Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR88Q9GZN0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR88Q9GZN0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms