Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRCC1Q9C099 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms