Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRNKL1Q9BZJ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms