Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABARAPL3Q9BY60 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms