Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SALL3Q9BXA9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms