Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GATA5Q9BWX5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATA5Q9BWX5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms