Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC94Q9BW85 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC94Q9BW85 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms